奏響人工智能藥研曙光曲
來(lái)源:醫藥經(jīng)濟報 更新時(shí)間:2024/1/31
近年來(lái),人工智能(AI)尤其是基于預訓練大模型的生成式AI技術(shù)為藥物產(chǎn)業(yè)的發(fā)展注入了新動(dòng)能,助力我國從制藥大國向制藥強國加速邁進(jìn)。
縱觀(guān)全球,AI已廣泛應用于藥物開(kāi)發(fā)的整個(gè)生命周期,實(shí)現了藥物開(kāi)發(fā)的降本增效,提高了臨床試驗的安全性與有效性。同時(shí),新技術(shù)也給藥品監管體系提出了新挑戰:如何適應醫藥領(lǐng)域新業(yè)態(tài)發(fā)展需求,使監管創(chuàng )新跟上技術(shù)與產(chǎn)業(yè)創(chuàng )新的步伐?統籌制定AI藥物研發(fā)的發(fā)展、安全和治理方案成為全球共識。
觀(guān)研發(fā)
AI在藥物研發(fā)中的使用,目前主要集中在早期藥物研發(fā)階段,旨在縮短臨床前藥物發(fā)現階段的研發(fā)周期。其中既包括藥物研發(fā)的底層技術(shù),如蛋白結構預測、分子表征預訓練等,也包括基于底層技術(shù)研發(fā)的應用技術(shù),如蛋白設計、虛擬篩選等。
底層技術(shù):提升預測成功率
底層技術(shù)的代表性工作,繞不開(kāi)谷歌DeepMind的AlphaFold,此為端到端的蛋白質(zhì)結構預測模型。該模型可直接根據蛋白質(zhì)的一級氨基酸序列準確預測蛋白質(zhì)的三維空間結構。相比傳統計算方法,其精度大幅度提升,甚至可以媲美成本極高的實(shí)驗方法,如冷凍電鏡,X射線(xiàn)晶體學(xué)等。
短短三年時(shí)間,基于A(yíng)lphaFold的研究工作已達數萬(wàn)件,包括基于此的多項衍生工作,如Meta公司的ESMFold與百度公司的HelixFold-Single。上述兩項工作都是通過(guò)蛋白質(zhì)語(yǔ)言模型加速蛋白質(zhì)的結構預測,并在特定類(lèi)型的蛋白上進(jìn)行了精度的提升。
除此之外,大量的研究工作也將蛋白結構預測模型應用在藥物靶點(diǎn)發(fā)現與驗證、藥物-蛋白質(zhì)相互作用、藥物設計與優(yōu)化等場(chǎng)景中。
另一類(lèi)底層技術(shù)的代表性工作是基于分子表征的預訓練大模型,其核心原理是通過(guò)海量無(wú)標注數據對分子進(jìn)行表征學(xué)習,在處理下游任務(wù)時(shí),通過(guò)高精度數據的微調,實(shí)現模型泛化性的提升。
代表性工作如微軟的Graphormer、百度的HelixGEM、深勢科技的Uni-Mol等化合物表征學(xué)習工作。該技術(shù)可以應用到下游的藥物屬性預測、虛擬篩選等場(chǎng)景,以提升藥物研發(fā)的成功率,降低濕實(shí)驗成本。
前沿應用:生成“自然未有”
在A(yíng)I掀起新一輪技術(shù)革命之前,蛋白質(zhì)設計局限在基于自然界已有蛋白質(zhì)?;诘讓蛹夹g(shù)研發(fā)的AI應用技術(shù),為人類(lèi)插上無(wú)限想象的翅膀,使創(chuàng )造自然界未有的蛋白質(zhì)成為現實(shí)。
該技術(shù)應用主要有兩項代表性工作,最有影響力的是華盛頓大學(xué)David Baker實(shí)驗室于2023年發(fā)表在《Nature》雜志上的RFDiffusion的工作。該方法基于擴散模型Diffusion對蛋白分子進(jìn)行設計,并在一個(gè)靶點(diǎn)上通過(guò)濕驗證論證了擴散模型在大分子藥物設計上的可行性。2023年12月18日,該實(shí)驗室宣布,其AI驅動(dòng)的蛋白質(zhì)已實(shí)現直接通過(guò)計算生成、無(wú)需任何實(shí)驗優(yōu)化的最高親和力。
另一項代表性工作是美國初創(chuàng )公司Generate:Biomedicines開(kāi)發(fā)的名為Chroma的生成式AI模型。該模型建立在擴散模型和圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò )的框架上,能夠從頭生成高質(zhì)量、多樣化和創(chuàng )新的蛋白質(zhì)結構。2023年11月,該公司在《Nature》雜志發(fā)表研究論文,表示已使用Chroma生成了300余個(gè)自然界中以前未發(fā)現的具有可編程特性的新型蛋白質(zhì),具有治療潛力,并在實(shí)驗室中取得了成功。
需指出的是,盡管AI在藥物研發(fā)領(lǐng)域表現出巨大潛力,在多個(gè)環(huán)節發(fā)揮出降本增效的作用,但目前其賦能藥物研發(fā)仍處于早期階段,在一些與藥物發(fā)現直接相關(guān)的具體問(wèn)題上,AI技術(shù)還有很大的提升空間,需要持續的投入。
候碩果
融資量?jì)r(jià)雙增
得益于技術(shù)的普及和發(fā)展, AI藥物研發(fā)市場(chǎng)正迎來(lái)爆發(fā)式增長(cháng)。相關(guān)預測顯示,到2025年,全球AI藥物研發(fā)市場(chǎng)規模將達38.8億美元,相當于約277億元人民幣。具體來(lái)看,北美仍是全球AI藥物研發(fā)市場(chǎng)的龍頭,聚集了超過(guò)一半的全球AI藥物研發(fā)企業(yè)。中國方面,根據《人工智能制藥深度產(chǎn)業(yè)報告》數據,2022年我國AI制藥市場(chǎng)規模達27億元,預計到2035年將增至2040億元。
AI藥物研發(fā)市場(chǎng)的蓬勃發(fā)展也體現在融資能力上。根據智藥局數據,2022年全球“人工智能+藥物研發(fā)”相關(guān)融資共計144起,總金額達62.02億美元(約合426.7億元人民幣)。與2021年相比,融資數量和金額均呈雙增長(cháng)趨勢。AI藥物研發(fā)投融資活動(dòng)主要集中在中國、美國和歐洲,其中美國融資事件達71起,中國為43起,其他國家和地區則有30起。
AI藥研藍?;盍Ρ虐l(fā),當前翻騰的浪花也相對較為集中——癌癥和精神類(lèi)疾病占比超過(guò)50%;其次是心腦血管、肝腎腸胃、呼吸系統,占比約30%;其他方面涉及糖尿病、眼病、白血病、感染性疾病、自身免疫疾病、藥物副作用等,也有少數企業(yè)在遺傳疾病及罕見(jiàn)病等小眾領(lǐng)域有所布局。
三類(lèi)主體筑基
目前全球AI藥物研發(fā)企業(yè)約700家。截至2022年,中國共有80家從事AI藥物研發(fā)的企業(yè),其中已有14家成功將其管線(xiàn)推進(jìn)至臨床階段,但大多數項目處于臨床Ⅰ期階段。
著(zhù)眼國內,包括傳統藥企/CRO/CDMO、AI驅動(dòng)的生物技術(shù)公司(下稱(chēng)Biotech)、互聯(lián)網(wǎng)頭部企業(yè)在內的三類(lèi)主體奠定市場(chǎng)總基調。各路玩家基于自身資源稟賦,有的與跨界巨擘強強聯(lián)手,有的專(zhuān)攻細分方向精修內功。
傳統藥企/CRO/CDMO企業(yè) 這些企業(yè)有數據和行業(yè)知識儲備,對行業(yè)上下游產(chǎn)業(yè)鏈熟悉,但AI算法能力相對不足,有意愿與AI公司合作。比如,賽諾菲和百度達成合作,基于mRNA算法進(jìn)行疫苗開(kāi)發(fā);輝瑞和谷歌的合作,基于A(yíng)lphaFold2探索藥物發(fā)現過(guò)程的加速等。除此之外,跨國大藥企如阿斯利康、諾華、拜耳等也與AI公司展開(kāi)合作。
Biotech公司 這類(lèi)企業(yè)往往專(zhuān)注于某一項細分領(lǐng)域,通過(guò)服務(wù)和專(zhuān)利授讓等模式變現。這類(lèi)企業(yè)偏向于組建自有AI研發(fā)團隊,打造核心技術(shù)能力。如薛定諤、英矽智能、Relay Therapeutics、Benevolent和Cyclica等。
互聯(lián)網(wǎng)頭部企業(yè) 依托其強大的AI技術(shù)和云計算優(yōu)勢,采用對外投資、內部組建AI藥研團隊等方式,進(jìn)入該領(lǐng)域。如百度的飛槳螺旋槳生物計算平臺、華為的醫療智能體平臺、騰訊的云深智藥平臺等都有相關(guān)布局。其中,百度在該領(lǐng)域的布局相對較早也較全面,除了在內部組建研發(fā)團隊外,在外部還成立了百圖生科,此為一家面向大分子藥物研發(fā)的Biotech公司。
需指出的是,雖然國內外AI制藥市場(chǎng)參與者眾多,但目前世界范圍內尚無(wú)AI設計的藥物獲批上市。
不過(guò),近年來(lái)含AI元素的新藥在注冊申請遞交量方面有較快增長(cháng)。據美國FDA藥品審評與研究中心(CDER)數據,其收到的含AI元素遞交已從2016年的個(gè)位數增加到2022年的175個(gè),疾病種類(lèi)涵蓋腫瘤、精神病、胃腸病、神經(jīng)病學(xué)等。也許在不遠的將來(lái),通過(guò)AI技術(shù)設計的藥物就能 “飛入尋常百姓家”。
總體而言,AI技術(shù)在藥物研發(fā)領(lǐng)域的應用還處于早期階段,技術(shù)的有效性和臨床效果還需要進(jìn)一步的跟蹤。
而除了滿(mǎn)足當前有關(guān)藥物安全性和有效性的監管要求外,在藥物開(kāi)發(fā)中使用AI技術(shù)還可能會(huì )帶來(lái)數據質(zhì)量和可用性、算法透明度、可靠性等挑戰。如今,國內外差距不斷縮小,伴隨著(zhù)國內創(chuàng )業(yè)公司和互聯(lián)網(wǎng)頭部企業(yè)快速崛起,傳統藥企/CRO企業(yè)的入場(chǎng),我國在A(yíng)I制藥領(lǐng)域的探索從技術(shù)、產(chǎn)品到監管體系正逐步走向成熟。
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